Могу ли я обновить часть файла HDF5 с помощью библиотеки Python h5py?

Ответ зависит от того, нужно ли вам сопоставлять совпадающие наборы скобок или просто сначала открыть последнее закрытие входного текста.

Если вам нужно сопоставить соответствующие вложенные скобки, тогда вам нужно нечто большее, чем регулярные выражения. - см. @dehmann

Если он просто открыт для последнего закрытия, см. @Zach

Решите, что вы хотите, чтобы :

abc ( 123 ( foobar ) def ) xyz ) ghij

Вам нужно решить, что ваш код должен соответствовать в этом случае.