как получить индекс отсортированных элементов массива

Для полноты, теперь есть fct_drop в пакете forcats http://forcats.tidyverse.org/reference/fct_drop.html .

Он отличается от droplevels тем, как он имеет дело с NA:

f <- factor(c("a", "b", NA), exclude = NULL)

droplevels(f)
# [1] a    b    
# Levels: a b 

forcats::fct_drop(f)
# [1] a    b    
# Levels: a b