Как вручную создать объект дендрограммы (или «hclust»)? (в R)

Question

Как вручную создать объект дендрограммы (или «hclust»)? (в R)

Единственный допустимый способ освобождения неиспользуемой памяти - использовать функцию члена shrink_to_fit (). Использование swap не имеет никакого смысла, поскольку в стандарте не говорится, что неиспользуемая память будет выпущена при использовании этой операции.

В качестве примера

s.clear();
s.shrink_to_fit();

14

dendrogram cluster-analysis r

задан OmG 5 July 2019 в 19:01

1 ответ

Другие вопросы по тегам:

dendrogram cluster-analysis r

Похожие вопросы:

score 25 · Accepted Answer

Я думаю, вам лучше создать объект hclust , а затем преобразовать его в дендрограмму, используя as.dendrogram , а затем попытаться создать дендрограмму напрямую. Посмотрите справочную страницу ? Hclust , чтобы увидеть значение элементов объекта hclust .

Вот простой пример с четырьмя листами A, B, C и D, объединяющими сначала AB, затем CD и, наконец, AB-CD:

a <- list()  # initialize empty object
# define merging pattern: 
#    negative numbers are leaves, 
#    positive are merged clusters (defined by row number in $merge)
a$merge <- matrix(c(-1, -2,
                    -3, -4,
                     1,  2), nc=2, byrow=TRUE ) 
a$height <- c(1, 1.5, 3)    # define merge heights
a$order <- 1:4              # order of leaves(trivial if hand-entered)
a$labels <- LETTERS[1:4]    # labels of leaves
class(a) <- "hclust"        # make it an hclust object
plot(a)                     # look at the result   

#convert to a dendrogram object if needed
ad <- as.dendrogram(a)