Это не возможно с ClickOnce. Приложения ClickOnce всегда устанавливаются в Apps
подкаталог данных локального приложения.
Как дальнейшее к вышеупомянутому, это - средство защиты. Разрешение веб-сайтов установить программное обеспечение на произвольных местоположениях на чьем-то жестком диске несколько автоматически является плохой идеей.