Существует ли быстрый способ изменить tabindexes на форме с большим количеством средств управления?

Для функции, принимающей массив типа char args[3][3][3], просто используйте это:

struct MateMessage newMate(char args[3][3][3])

Или в случае, если размеры должны быть переменными:

struct MateMessage newMate(size_t x, size_t y, size_t z, char args[x][y][z])