Я сказал бы, что это не в духе Java для выполнения сценария оболочки от Java. Java предназначен, чтобы быть кросс-платформенным, и выполнение сценария оболочки ограничило бы свое использование просто UNIX.
После этих слов определенно возможно выполнить сценарий оболочки из Java. Вы использовали бы точно тот же синтаксис, который Вы перечислили (я не попробовал его сам, но пытаюсь выполнить сценарий оболочки непосредственно, и если это не работает, выполните саму оболочку, передав сценарий в как параметр командной строки).
Звучит как проблема с настройкой на вашей стороне, которую мы не можем решить без дополнительной информации. Вы пробовали использовать абсолютный URL вместо относительного?
Пример:
<link rel="shortcut icon" href="http://mydomain.com/images/favicon.ico" />
Возможно, первая косая черта в
href="/images/favicon.ico"вызывает проблему?
Вы пробовали
<link rel="shortcut icon" href="images/favicon.ico" />
? Какова структура каталогов для субдомена www? Можете ли вы получить доступ к другим файлам изображений, используя абсолютный путь?
Fireworks часто автоматически выбирает файл favicon.ico без кода, если это та же папка, что и документ. Попробуйте переместить файл на уровень выше, чтобы избежать проблем со ссылками.