Таблица запросов SQL на основе запроса из альтернативной таблицы

Вы переопределяете переменную $result. Просто используйте другую переменную, и вы должны быть в порядке:

$app = $row["AppID"];
$sqlApp = "SELECT * FROM core_apps WHERE AppID = $app";
$resultApp = $conn->query($sqlApp);

Вы объявили переменную с помощью SQL-запроса, и вы должны получить данные из нее, в том же цикле вы объявляете новую переменную с тем же именем, и содержимое результата в первом будет заменено запросом результата. во втором запросе, и это не правильно, вы должны использовать разные имена переменных для сохранения первого результата