Как я могу заблокировать репо, чтобы я следующий в очереди на слияние?

Ваша вторая попытка правильная, но вы пропускаете guild.member как пользователь, но это не GuildMember (это undefined). Попробуйте передать UserResolvable , например message.author или message.member.

message.guild.channels.find('name', 'loups-garous').overwritePermissions("user_id", { //first you pass the id OR the member OR the user OR a role
  VIEW_CHANNEL: true, //you set the perms that you want to overwrite
  SEND_MESSAGES: true,
  READ_MESSAGE_HISTORY: true,
  ATTACH_FILES: false
});