Как прочитать набор данных многомерного массива HDF5, используя HDF5DotNet из C # .net?

Question

Как прочитать набор данных многомерного массива HDF5, используя HDF5DotNet из C # .net?

Я знаю, что это старый вопрос, но это общая проблема, и у меня есть решение, которое кажется более простым, чем предлагаемые до сих пор:

def stringify_children(node):
    """Given a LXML tag, return contents as a string

       >>> html = "<p><strong>Sample sentence</strong> with tags.</p>"
       >>> node = lxml.html.fragment_fromstring(html)
       >>> extract_html_content(node)
       "<strong>Sample sentence</strong> with tags."
    """
    if node is None or (len(node) == 0 and not getattr(node, 'text', None)):
        return ""
    node.attrib.clear()
    opening_tag = len(node.tag) + 2
    closing_tag = -(len(node.tag) + 3)
    return lxml.html.tostring(node)[opening_tag:closing_tag]

В отличие от некоторых других ответов на этот вопрос это решение сохраняет все теги, содержащиеся в нем, и атакует проблему под другим углом, чем другие рабочие решения.

0

c# .net hdf5 hdf5dotnet

задан Doug Null 15 January 2019 в 20:43

2 ответа

Другие вопросы по тегам:

c# .net hdf5 hdf5dotnet

Похожие вопросы:

score 0 · Answer 1

Я получил это работает. Вот мой код ...

    // Reads a 2-dim array of double.
// INPUT:  fileId of open HDF5 file
public static bool  read_double_array( H5FileId fileId, string dataset_name, int dim1, int dim2, ref double [,] output_double_array )
{

    try
    {
        output_double_array = new double[ dim1, dim2 ];
        H5Array<double> h5_array = new H5Array<double>( output_double_array );
        H5DataSetId dataset = H5D.open( fileId, dataset_name);
        H5D.read<double>(   dataset, 
                            new H5DataTypeId(H5T.H5Type.NATIVE_DOUBLE), 
                            h5_array);
    }
    catch( HDFException e )
    {
        Console.WriteLine( e.Message );
        return false;
    }
    return true;
}

score 0 · Answer 2

Избавьтесь от серьезной боли (из-за подробностей реализации низкого уровня HDF5) и посмотрите HDFql .

Здесь приводится решение с использованием HDFql в C # для чтения многомерного (размер 3x3) набора данных с именем dset типа данных double, хранящегося в файле HDF5 с именем test.h5 (предположим, что и файл, и набор данных уже существуют) :

// use HDFql namespace (make sure it can be found by the C# compiler)
using AS.HDFql;

public class Test
{
    public static void Main(string []args)
    {
        // declare variables
        double [,]data = new double[3, 3];
        int x;
        int y;

        // use (i.e. open) HDF file "test.h5"
        HDFql.Execute("USE FILE test.h5");

        // register variable "data" for subsequent use (by HDFql)
        HDFql.VariableRegister(data);

        // select (i.e. read) dataset "dset" into variable "data"
        HDFql.Execute("SELECT FROM dset INTO MEMORY " + HDFql.VariableGetNumber(data));

        // unregister variable "data" as it is no longer used/needed (by HDFql)
        HDFql.VariableUnregister(data);

        // display content of variable "data"
        for(x = 0; x < 3; x++)
        {
            for(y = 0; y < 3; y++)
            {
                System.Console.WriteLine(data[x, y]);
            }
        }
    }
}