как jvm загружает разные jar-файлы, но с одним и тем же именем пакета и именем класса?

Я подозреваю, что есть два способа справиться с тем, что, как я думаю, вы пытаетесь достичь.

1), что очевидно, открывает файл только для чтения, читает его в памяти и открывает файл с помощью t, затем запишите свои изменения.

2) используйте подпрограммы обработки файлов низкого уровня:

# Open file in RW , create if it doesn't exist. *Don't* pass O_TRUNC
 fd = os.open(filename, os.O_RDWR | os.O_CREAT)

Надеюсь, это поможет ..