Почему этот col Bootstrap удаляет пробелы?

Скорее всего, mysql.sock не существует в /var/lib/mysql/.

Если вы найдете тот же файл в другом месте, тогда symlink его:

Например: у меня это есть /data/mysql_datadir/mysql.sock

Переключить пользователя в mysql и выполнить, как указано ниже:

su mysql

ln -s /data/mysql_datadir/mysql.sock /var/lib/mysql/mysql.sock

Это решило мою проблему