Вот мой код: import matplotlib.pyplot как plt import pandas как pd из иерархии импорта scipy.cluster как hier df = pd.read_excel ('some_symmetricmatrix.xlsx') Z = hier.linkage (df, 'ward') ...
У меня есть две древовидных схемы, которые я хочу сравнить друг с другом, чтобы узнать, насколько "подобный" они. Но я не знаю ни о каком методе, чтобы сделать так (уже не говоря о коде для реализации его, скажем, в R). Любой...
У меня есть дендрограмма, данная мне как изображения. Поскольку он не очень большой, я могу построить его «вручную» в объекте R. Поэтому мой вопрос заключается в том, как вручную создать объект дендрограммы (или hclust), когда ...
Я генерировал эту древовидную схему с помощью R hclust (), as.dendrogram () и plot.dendrogram () функции. Я использовал dendrapply () функция и локальная функция для окраски листов, который хорошо работает. Я имею...
Я сгруппировал множество изображений и представляю их в дендрограмме, Dendrogram показывает таблицы, которые ближе всего к кластерам и насколько они различны. Я также успел показать имена изображений, но я ...
Там какой-либо путь состоит в том, чтобы генерировать древовидную схему, где каждый уровень графика представляет поколение, и только сыновья того же родительского элемента соединены на каждом уровне? Я пытаюсь использовать R hclust и график...
Я использую APE (анализ филогенетики и эволюции) пакета в R, имеющих функциональность рисунка Dendrogram. Я использую следующие команды, чтобы прочитать данные в формате Newikk, и нарисовать дендрограмму, используя ...
Используя дневную историю цен акций, я рассчитал матрицу корреляции. С кодом ниже, я получаю простую дендрограмму дерева. Но я хотел бы построить дендрограмму круга, упомянутую в этой ссылке. ...
I ' Я нашел несколько примеров того, как создавать эти точные иерархии (по крайней мере, я так считаю), например, приведенные ниже stackoverflow.com/questions/2982929/, которые отлично работают и почти работают ...
У меня есть список векторов, созданный путем выполнения: import hcluster
import numpy as np
from ete2 import Tree vecs = [np.array(i) for i in document_list] where document_list is a collection of web ...
Я хочу сделать простое филогенетическое дерево для курса морской биологии в качестве учебного примера. У меня есть список видов с таксономическим рангом :Группа < -c («Бентос», «Бентос», «Бентос», «Бентос», «...
У меня есть ранжированная матрица корреляции. Я хотел визуализировать половину треугольной корреляционной матрицы с помощью цветной дендрограммы heatmap.2 с функцией «gplots», где я потерпел неудачу, потому что не знаю, как это сделать ...
Я хочу изменить свойства листьев в дендрограмме, созданной из графика объекта hclust. Как минимум, я хочу изменить цвета, но любая помощь, которую вы можете оказать, будет оценена по достоинству. Я сделал ...
Имея древовидную диаграмму, такую как дендрограмма, пример (, источник ), как можно поместить метки на ребра? Код Javascript для рисования ребер выглядит следующим образом: :var link = vis.selectAll ("path.link" )...
Я знаю, что дендрограммы довольно популярны. Однако, если имеется довольно большое количество наблюдений и классов, за ними трудно следить. Однако иногда я чувствую, что должен быть лучший способ представить то же самое...
Я использую Scipy для иерархической кластеризации. Мне удается получить плоские кластеры на пороге, используя fcluster. Но мне нужно визуализировать сформированную дендрограмму. Когда я использую метод дендрограммы, он работает...
Я написал свою собственную процедуру кластеризации и хотел бы создать дендрограмму. Самый простой способ сделать это — использовать функцию дендрограммы scipy. Однако для этого требуется, чтобы входные данные находились в ...
Я использую дендрограмму от scipy для построения иерархической кластеризации с использованием matplotlib следующим образом: mat = array ([[1, 0.5, 0.9], [0.5, 1, -0.5], [0.9, -0.5, 1]]) plt. участок (1,2,1) ...
Я хочу написать код для рисования дендрограммы на питоне. есть ли простой способ сделать это. Я написал код, который идентифицирует кластеры в точечном наборе данных, и хочу создать дендрограмму...
Я использую следующий код R для создания дендрограммы (см. прикрепленное изображение )с метками на основе последовательностей TraMineR :библиотека (TraMineR )библиотека (кластер )clusterward < -agnes (twitter.om, diss = TRUE,...
Я новичок в d3.js (и SVG в целом), и я хочу сделать что-то простое:дерево/дендрограмму с угловыми соединители. Я каннибализировал пример d3 отсюда:http://mbostock.github.com/d3/ex/...
Я столкнулся с таким графиком, который выполняет иерархическую кластеризацию заданного набора данных временных рядов. Может кто-нибудь сказать мне, как рисовать такие сюжеты? Я открыт для реализации на R или...
У меня есть простой двухмерный набор данных, который я хочу кластеризовать агломеративным способом (не зная оптимальное количество кластеров для использования). Единственный способ, которым я смог успешно сгруппировать свои данные ...
Я хотел бы экспортировать дендрограмму hclust-из R в таблицу данных, чтобы впоследствии импортировать ее в другую ("домашнюю-сделанную")программное обеспечение. str(unclass(fit))предоставляет текстовый обзор для...
У меня есть ситуация, когда я рисую дендрограмму с точками данных, которые идут с метками классов. Я хочу видеть, что агломеративная кластеризация объединяет людей с одним и тем же ярлыком. Цвет ...
Я реализовал алгоритм для решения проблемы кластеризации в графе. Я использовал библиотеку Python «python-graph» для представления графа. Теперь, на каждом этапе моих вычислений (алгоритм ...
Я использую scipy-кластер для генерации иерархической кластеризации на некоторых данных. Как заключительный шаг приложения, я вызываю функцию древовидной схемы для графического изображения кластеризации. Я работаю на Снегу Mac OS X...