19
ответов

Проблема установки / компиляции HDF5 с пакетами C ++ на Linux [duplicate]

В настоящее время я выполняю симуляцию, реализованную на C ++, и планирую хранить данные в виде файлов HDF5. На моем MacBook я установил HDF5 через исходный код с веб-страницы HDFgroup. ...
вопрос задан: 21 January 2018 18:39
6
ответов

Поиск чего-то подобного offsetof () для типов не-POD

Я ищу способ получить смещения элементов данных класса C++, который имеет природу не-POD. Вот то, почему: я хотел бы хранить данные в формате HDF5, который кажется самым подходящим для моего вида материала...
вопрос задан: 7 October 2008 12:36
4
ответа

Python, PyTables, Java - связывающий все

Вопрос в ореховой скорлупе, Что лучший способ состоит в том, чтобы заставить Python и Java играть по правилам друг с другом? Более подробное объяснение у меня есть несколько сложная ситуация. Я буду стараться изо всех сил объяснять обоих...
вопрос задан: 23 May 2019 13:04
4
ответа

Как лучше всего выписать станд.:: вектор <станд.:: строка> контейнер к набору данных HDF5?

Учитывая вектор строк, что лучший способ состоит в том, чтобы выписать им к набору данных HDF5? В данный момент я делаю что-то как следующее: константа неподписанный международный MaxStrLength = 512; структура...
вопрос задан: 24 February 2009 11:25
3
ответа

Как написать эффективный цикл для доступа к наборам данных внутри 1000 файлов h5 в R [duplicate]

filename & lt; - h5file ("file.h5", 'r') filename H5File 'file.h5' (режим 'r') + XYZ имя файла ["/ XYZ /"] В «XYZ» есть несколько групп, а затем наборы данных внутри них. Имена групп варьируются от файла к ...
вопрос задан: 5 July 2013 14:53
3
ответа

Мнения о NetCDF по сравнению с HDF5 для того, чтобы хранить научные данные?

У кого-либо там есть достаточно w/NetCDF опыта и HDF5 для предоставления некоторых плюсов / минусы о них как способ хранить научные данные? Я использовал HDF5 и хотел бы к чтению-записи через Java, но...
вопрос задан: 14 January 2012 15:50
2
ответа

Как прочитать набор данных многомерного массива HDF5, используя HDF5DotNet из C # .net?

Мне нужно прочитать набор данных HDF5, который содержит массив 3 x 3, тип данных двойной. Моя Visual Studio 2017 Pro дает сбой при возврате из моего кода ниже. Начиная с отладчика, этот код читает 2-дим ...
вопрос задан: 15 January 2019 20:43
2
ответа

Оценка HDF5: Какие ограничения/функции HDF5 предусматривает моделирование данных?

Мы находимся в оценке технологий, которые мы будем использовать, чтобы хранить данные, которые мы собираем во время анализа кода C/C++. В случае C++ объем данных может быть относительно большим, ~20Mb на TU. После...
вопрос задан: 23 May 2017 12:09
2
ответа

Поиск набора данных HDF5

Я в настоящее время исследую HDF5. Я прочитал интересные комментарии из потока, "Оценивающего HDF5", и я понимаю, что HDF5 является предпочтительным решением для того, чтобы хранить данные, но как Вы запрашиваете его?...
вопрос задан: 23 May 2017 11:45
2
ответа

общие местоположения библиотеки для matlab файлов MEX:

Я пытаюсь записать matlab mex функция, которая использует libhdf5; Моя установка Linux обеспечивает, libhdf5-1.8 совместно использовал библиотеки и заголовки. Однако моя версия Matlab, r2007b, обеспечивает libhdf5.so от...
вопрос задан: 4 February 2010 22:26
1
ответ

Не удается получить наборы данных в PyTables с использованием естественного именования

Я новичок в PyTables, и я хочу получить набор данных из HDF5 с использованием естественного именования, но я получаю эту ошибку, используя этот ввод: f = tables.open_file ("filename.h5", "r") f.root. группы 1.dataset-1 ....
вопрос задан: 17 March 2019 20:33
1
ответ

& ldquo; Большие данные & rdquo; рабочие потоки с использованием панд

Я пытался найти ответ на этот вопрос в течение многих месяцев, изучая панд. Я использую SAS для своей повседневной работы, и он отлично подходит для поддержки из ядра. Однако SAS ужасен ...
вопрос задан: 22 September 2017 17:44
1
ответ

Обертка HDF5.Net

Я добираюсь (http://www.hdfgroup.org/projects/hdf.net/), указанный модуль не мог быть найден. (Исключение из HRESULT: 0x8007007E) от зависимости Уокер я вижу тот SZLIBDLL.DLL...
вопрос задан: 1 June 2010 21:30
1
ответ

R и проблемы HDF5

Я пытаюсь загрузить hdf5 в R и сталкиваюсь с некоторыми проблемами. Вот шаги, которые я сделал для конфигурирования моей среды: R 2.10.0 (x64) на Mac OS X 10,6 hdf5 1.8.3 установлены через macports hdf5_1.6.9....
вопрос задан: 12 November 2009 21:40
1
ответ

Разделенный на блоки HDF5 DataSet и slabsize

Мы оцениваем производительность HDF5 относительно фрагментированных наборов данных. Особенно мы пытаемся выяснить, возможно ли читать через различные непрерывные блоки и как на производительность влияют...
вопрос задан: 24 July 2009 13:37
1
ответ

Удаление данных из файла HDF5

У меня есть файл HDF5 с одномерным (N x 1) набор данных составных элементов - на самом деле это - временной ряд. Данные сначала собраны офлайн в файл HFD5 и затем проанализированы. Во время...
вопрос задан: 14 July 2009 13:43
0
ответов

Как добавить данные в один конкретный набор данных в файле hdf5 с помощью h5py

Я ищу возможность добавить данные в существующий набор данных в файле .h5 с помощью Python (h5py). Краткое введение в мой проект: я пытаюсь обучить CNN, используя данные медицинского изображения. Из-за ...
вопрос задан: 21 September 2019 19:55
0
ответов

Как построить базу данных файлов HDF5

Я изучал возможности хранения данных HDF5 и нашел его полезным для хранения больших результатов. У меня есть куча файлов hdf5 на моей локальной машине, с другой иерархической структурой. ...
вопрос задан: 4 April 2019 10:00
0
ответов

Проблема со связыванием torch и hdf5 lib вместе

Я пытаюсь настроить свой проект на C ++ с использованием файлов HDF5 и pyTorch (C ++ API), и есть некоторые проблемы с линковкой. Итак ... Я запускаю Ubuntu 18.04 LTS. Я установил HDF5 с APT, затем я загружаю ...
вопрос задан: 18 January 2019 21:24
0
ответов

Самый быстрый способ записать файлы HDF5 с помощью Python?

Учитывая большой (10 ГБ) CSV-файл со смешанным текстом и числами, каков самый быстрый способ создать файл HDF5 с тем же содержимым, сохраняя разумное использование памяти? Я бы хотел использовать h5py ...
вопрос задан: 15 May 2018 07:52
0
ответов

TensorFlow - tf.data.Dataset для чтения больших файлов HDF5

Я настраиваю конвейер TensorFlow для чтения больших файлов HDF5 в качестве входных данных для моих моделей глубокого обучения. Каждый файл HDF5 содержит 100 видео переменной длины, хранящихся в виде коллекции сжатых ...
вопрос задан: 29 April 2018 08:37
0
ответов

Постоянство данных научного моделирования, Mongodb + HDF5?

Я разрабатываю программный пакет для моделирования методом Монте-Карло, который включает в себя множество физики и симуляторов. Мне нужно проводить онлайн-анализ, отслеживать зависимость производных данных от исходных данных, а также выполнять ...
вопрос задан: 23 May 2017 12:23
0
ответов

h5py выдает ошибку после установки [дубликат]

Возможный дубликат: установка h5py на OS X Я пытаюсь заставить h5py работать на моем OS X Lion 10.7.3 Macbook Pro. Раньше он работал, но каким-то образом он был удален, и я не могу его установить...
вопрос задан: 23 May 2017 12:00
0
ответов

Удаление информации из файла HDF5

Я понимаю, что пользователь SO ранее задавал этот вопрос, но он был задан в 2009 году, и я надеялся, что было доступно больше знаний о HDF5 или в более новых версиях эта конкретная проблема была устранена. Чтобы ...
вопрос задан: 23 May 2017 11:46
0
ответов

Интерфейс HDF5 C ++: запись динамических 2D массивов

Я использую API HDF5 C ++ для записи файлов набора данных массива 2D. HDF Group имеет пример для создания файла HDF5 из статически определенного размера массива, который я модифицировал, чтобы набирать мои потребности ниже. ...
вопрос задан: 23 May 2017 11:46
0
ответов

Совместное использование больших наборов данных между Matlab и R

Мне нужен относительно эффективный способ обмена данными между Matlab и R. Я проверил SaveR и MATLAB R-link, но SaveR форматирует двоичные данные Matlab сначала как текстовые строки, а затем печатает их в ...
вопрос задан: 20 March 2017 10:04
0
ответов

MATLAB: Сохранение нескольких переменных в «-v7.3» (HDF5) .mat-files кажется быстрее при использовании флага «-append». Почему?

ПРИМЕЧАНИЕ: Этот вопрос касается проблемы, наблюдаемой еще в 2011 году со старой версией MATLAB (R2009a). Согласно обновлению ниже от июля 2016 года проблема / ошибка в MATLAB, похоже, больше не существует (проверено с помощью ...
вопрос задан: 15 July 2016 12:17
0
ответов

Подходит ли hdf5 для измерения реального -времени

Я хотел бы знать, подходит ли hdf5 для регистрации данных в реальном -времени или нет? Точнее :Я работаю над проектом, в котором мы хотим постоянно (частоту дискретизации в диапазоне от 30 до 400 Гц )микшировать с хорошей...
вопрос задан: 22 January 2016 09:02
0
ответов

Объедините большое количество файлов HDF5

У меня есть около 500 файлов HDF5, каждый примерно по 1,5 ГБ. Каждый из файлов имеет одинаковую точную структуру, которая состоит из 7 составных (int, double, double) наборов данных и переменного количества выборок. Теперь я хочу ...
вопрос задан: 19 January 2016 23:12
0
ответов

HDF5 в Java: В чем разница между доступными API?

Я только что открыл для себя формат HDF5 и подумываю о том, чтобы используя его для хранения трехмерных данных, распределенных по кластеру серверов приложений Java. Я обнаружил, что существует несколько доступных реализаций ...
вопрос задан: 22 December 2015 23:02