Настроить кнопки в QWIzard?

Попробуйте это (не тестировалось):

case "png":
  $file = imagecreatetruecolor($width, $height);
  $new = imagecreatefrompng($this->file_tempname);
  imagefilledrectangle ($file, 0, 0, $width, $height, imagecolorallocate($file, 0,0,0))

(предварите белый фон на $ file image)

Кроме того, часть for($i=0; $i<256; $i++) { imagecolorallocate($file, $i, $i, $i); } выглядит странно.