Хотя это несколько личное предпочтение, я пошел с этим (для проекта только для андроида). Удаление большинства, но сохранение того, что принято
ToonPlane/platforms/android/*
!ToonPlane/platforms/android/AndroidManifest.xml
ToonPlane/plugins/*
!ToonPlane/plugins/android.json
!ToonPlane/plugins/fetch.json