Операционные системы и управление памятью (теоретическое)

Я использовал пакет rgdal для чтения файлов HDF5. Вам нужно позаботиться о том, чтобы, вероятно, двоичная версия rgdal не поддерживала hdf5. В этом случае вам нужно построить gdal из источника с поддержкой HDF5, прежде чем строить rgdal из источника.

В качестве альтернативы попробуйте преобразовать файлы с hdf5 в netcdf. Как только они находятся в netcdf, вы можете использовать отличный пакет ncdf для доступа к данным. Преобразование, я думаю, может быть сделано с помощью инструмента cdo .