JPA заблокировать в @ManyToOne

Нет прямого пути, но если вы действительно заинтересованы в отслеживании этой информации, вы можете создать поле private static int instanceCounter и увеличить его в своих конструкторах. Вам также понадобится метод finalize, который уменьшает счетчик всякий раз, когда экземпляр собирает мусор.