вызовите основной метод в Java-модуле, используя JNI

Вы также можете, и это мой любимый, установить папку как статический путь, чтобы файлы внутри были доступны для всех.

app = Flask(__name__, static_url_path='/static')

С помощью этого набора вы можете использовать стандартный HTML:

<link rel="stylesheet" type="text/css" href="/static/style.css">