Вот код, который работает во всех версиях Python: от 2.7-3.5 и, возможно, даже от других.
config_file = "/tmp/config.py"
with open(config_file) as f:
code = compile(f.read(), config_file, 'exec')
exec(code, globals(), locals())
Я его протестировал. Это может быть уродливым, но до сих пор это единственное, что работает во всех версиях.