Для Laravel 5 вы отредактируете один из файлов .stub
в:
vendor/laravel/framework/src/Illuminate/Database/Migrations/stubs
Нет причин, по которым вы не можете редактировать эти файлы.
Поиск в vendor/laravel/framework/src/
для файлов .stub
, чтобы найти все другие заглушки (шаблоны), используемые мастером.