Взаимодействие Phpseclib и OpenSSL rsautl при подписывании

Есть ли способ получить ссылку на логическую переменную из std :: Vector?

No.

Или любой другой решение?

Вернуть typename std::vector<T>::reference вместо T&. Для bool он вернет тип прокси-объекта вектора;

Или специализируйте A<bool>, чтобы использовать что-то, кроме vector<bool>.

Или используйте какой-либо другой тип (возможно, char, или простой класс, обертывающий bool) вместо bool.