Проблема с шаблоном отчета Jasper в columnFooter

Используйте псевдоколонку rowid.

DELETE FROM your_table
WHERE rowid not in
(SELECT MIN(rowid)
FROM your_table
GROUP BY column1, column2, column3);

Где column1, column2 и column3 составляют идентификационный ключ для каждой записи. Вы можете указать все свои столбцы.