Код Filechooser, кажется, немного не

DELETE from table_name where rowid not in (select min(rowid) FROM table_name group by column_name);

, и вы также можете удалить повторяющиеся записи другим способом

DELETE from table_name a where rowid > (select min(rowid) FROM table_name b where a.column=b.column);