Чтобы предотвратить двойное кодирование, рекомендуется декодировать url перед кодированием (если вы имеете дело с введенными пользователем URL-адресами, например, которые могут быть уже закодированы).
Допустим, что у нас есть abc%20xyz 123
как вход (одно пространство уже закодировано):
encodeURI("abc%20xyz 123") // wrong: "abc%2520xyz%20123"
encodeURI(decodeURI("abc%20xyz 123")) // correct: "abc%20xyz%20123"