При использовании propedit убедитесь, что у вас нет конечных пробелов, так как это приведет к тому, что файл будет исключен из списка игнорирования.
Они автоматически вставлены, если вы используете tab-autocomplete для linux для создания файл для начала:
svn propset svn:ignore 'file1
file2' .