заменить весь файл другим файлом в bash

Вы не могли итерировать или хранить больше данных, чем длина вашего массива. В этом случае вы можете сделать так:

for (int i = 0; i <= name.length - 1; i++) {
    // ....
}

Или это:

for (int i = 0; i < name.length; i++) {
    // ...
}