Я не знаю никаких автоматических инструментов, но здесь есть общее руководство: http://www.scipy.org/NumPy_for_Matlab_Users
В общем, я бы просто посмотрите на документацию numpy, которая очень хороша. Некоторые имена методов отображаются напрямую, хотя есть различия. Мне не потребовалось много времени, чтобы перейти от Matlab к Numpy, когда я сделал прыжок пару лет назад.