Используйте NSUserDefaults, чтобы установить приложение независимо от того, обновлено или нет. Если обновлено, то очистите основные данные из приложения. Поместите эту ссылку, чтобы сбросить основные данные: link
, когда ваш обновление выполнено:
[[NSUserDefaults standardUserDefaults]setBool:TRUE forKey:@"isUpdated"]
, затем проверьте значение того же самого при запуске приложения.