Id идет с MySql, так как это очень легкий вес. PHP и MySql хорошо ладят. Так как у вас будет много обновлений, и многие читают в базе данных, движок InnoDB будет использовать этот сценарий лучше всего. Вы можете столкнуться с проблемами, если вы выберете MyIsam, так как он подходит для одного задания за раз (обновление или чтение).