Как WhatsApp преодолевает задержку push-уведомлений GCM?

Вы можете использовать текстовое сообщение HTML5 ... но это своего рода передний край.

Даже в этом случае вам, вероятно, понадобится захватить тег 'click' событие с javascript и открыть окно самостоятельно, чтобы у вас был доступ к новому объекту окна для публикации сообщений.