Создать zip-файл из генератора в Python?

Хотя я недавно стал конвертером в dplyr для большинства этих типов операций, пакет sqldf по-прежнему очень хорош (и IMHO более читабельным) для некоторых вещей.

Вот пример того, как можно ответить на этот вопрос с помощью sqldf

x <- data.frame(Category=factor(c("First", "First", "First", "Second",
                                  "Third", "Third", "Second")), 
                Frequency=c(10,15,5,2,14,20,3))

sqldf("select 
          Category
          ,sum(Frequency) as Frequency 
       from x 
       group by 
          Category")

##   Category Frequency
## 1    First        30
## 2   Second         5
## 3    Third        34
19
задан Chris B. 18 November 2008 в 19:08
поделиться

6 ответов

Единственное решение состоит в том, чтобы переписать метод, который оно использует для архивирования файлов для чтения из буфера. Это было бы тривиально, чтобы добавить это к стандартным библиотекам; я отчасти поражен, что это еще не было сделано. Я заключаю, что существует много соглашения, весь интерфейс должен быть перестроен, и это, кажется, блокирует любые последовательные усовершенствования.

import zipfile, zlib, binascii, struct
class BufferedZipFile(zipfile.ZipFile):
    def writebuffered(self, zipinfo, buffer):
        zinfo = zipinfo

        zinfo.file_size = file_size = 0
        zinfo.flag_bits = 0x00
        zinfo.header_offset = self.fp.tell()

        self._writecheck(zinfo)
        self._didModify = True

        zinfo.CRC = CRC = 0
        zinfo.compress_size = compress_size = 0
        self.fp.write(zinfo.FileHeader())
        if zinfo.compress_type == zipfile.ZIP_DEFLATED:
            cmpr = zlib.compressobj(zlib.Z_DEFAULT_COMPRESSION, zlib.DEFLATED, -15)
        else:
            cmpr = None

        while True:
            buf = buffer.read(1024 * 8)
            if not buf:
                break

            file_size = file_size + len(buf)
            CRC = binascii.crc32(buf, CRC) & 0xffffffff
            if cmpr:
                buf = cmpr.compress(buf)
                compress_size = compress_size + len(buf)

            self.fp.write(buf)

        if cmpr:
            buf = cmpr.flush()
            compress_size = compress_size + len(buf)
            self.fp.write(buf)
            zinfo.compress_size = compress_size
        else:
            zinfo.compress_size = file_size

        zinfo.CRC = CRC
        zinfo.file_size = file_size

        position = self.fp.tell()
        self.fp.seek(zinfo.header_offset + 14, 0)
        self.fp.write(struct.pack("<LLL", zinfo.CRC, zinfo.compress_size, zinfo.file_size))
        self.fp.seek(position, 0)
        self.filelist.append(zinfo)
        self.NameToInfo[zinfo.filename] = zinfo
12
ответ дан 30 November 2019 в 04:04
поделиться

gzip. GzipFile пишет данные в блоках gzipped, которые можно установить размер блоков согласно числам строк, считанных из файлов.

пример:

file = gzip.GzipFile('blah.gz', 'wb')
sourcefile = open('source', 'rb')
chunks = []
for line in sourcefile:
  chunks.append(line)
  if len(chunks) >= X: 
      file.write("".join(chunks))
      file.flush()
      chunks = []
3
ответ дан 30 November 2019 в 04:04
поделиться

Существенное сжатие сделано zlib.compressobj. ZipFile (в соответствии с Python 2.5 на MacOSX, кажется, компилируется). Версия Python 2.3 следующие.

Вы видите, что это создает сжатый файл в блоках 8k. Вынимание информации об исходном файле сложно, потому что много атрибутов исходного файла (как несжатый размер) зарегистрировано в заголовке zip-файла.

def write(self, filename, arcname=None, compress_type=None):
    """Put the bytes from filename into the archive under the name
    arcname."""

    st = os.stat(filename)
    mtime = time.localtime(st.st_mtime)
    date_time = mtime[0:6]
    # Create ZipInfo instance to store file information
    if arcname is None:
        zinfo = ZipInfo(filename, date_time)
    else:
        zinfo = ZipInfo(arcname, date_time)
    zinfo.external_attr = st[0] << 16L      # Unix attributes
    if compress_type is None:
        zinfo.compress_type = self.compression
    else:
        zinfo.compress_type = compress_type
    self._writecheck(zinfo)
    fp = open(filename, "rb")

    zinfo.flag_bits = 0x00
    zinfo.header_offset = self.fp.tell()    # Start of header bytes
    # Must overwrite CRC and sizes with correct data later
    zinfo.CRC = CRC = 0
    zinfo.compress_size = compress_size = 0
    zinfo.file_size = file_size = 0
    self.fp.write(zinfo.FileHeader())
    zinfo.file_offset = self.fp.tell()      # Start of file bytes
    if zinfo.compress_type == ZIP_DEFLATED:
        cmpr = zlib.compressobj(zlib.Z_DEFAULT_COMPRESSION,
             zlib.DEFLATED, -15)
    else:
        cmpr = None
    while 1:
        buf = fp.read(1024 * 8)
        if not buf:
            break
        file_size = file_size + len(buf)
        CRC = binascii.crc32(buf, CRC)
        if cmpr:
            buf = cmpr.compress(buf)
            compress_size = compress_size + len(buf)
        self.fp.write(buf)
    fp.close()
    if cmpr:
        buf = cmpr.flush()
        compress_size = compress_size + len(buf)
        self.fp.write(buf)
        zinfo.compress_size = compress_size
    else:
        zinfo.compress_size = file_size
    zinfo.CRC = CRC
    zinfo.file_size = file_size
    # Seek backwards and write CRC and file sizes
    position = self.fp.tell()       # Preserve current position in file
    self.fp.seek(zinfo.header_offset + 14, 0)
    self.fp.write(struct.pack("<lLL", zinfo.CRC, zinfo.compress_size,
          zinfo.file_size))
    self.fp.seek(position, 0)
    self.filelist.append(zinfo)
    self.NameToInfo[zinfo.filename] = zinfo
3
ответ дан 30 November 2019 в 04:04
поделиться

Некоторые (многие? большинство?) алгоритмы сжатия основаны на рассмотрении дублирований через цельный файл.

Некоторые библиотеки сжатия выберут между несколькими алгоритмами сжатия на основе который работы лучше всего над файлом.

я полагаю, что модуль ZipFile делает это, таким образом, он хочет видеть весь файл, не просто части за один раз.

Следовательно, это не будет работать с генераторами или файлами к большому для загрузки в памяти. Это объяснило бы ограничение библиотеки Zipfile.

2
ответ дан 30 November 2019 в 04:04
поделиться

gzip библиотека возьмет подобный файлу объект для сжатия.

class GzipFile([filename [,mode [,compresslevel [,fileobj]]]])

все еще необходимо обеспечить номинальное имя файла для включения в zip-файл, но можно передать источник данных fileobj.

(Этот ответ отличается от ответа Damnsweet, в которых фокус должен быть на инкрементно считанном источнике данных, не инкрементно записанный сжатый файл.)

И я вижу теперь, что исходный корреспондент не примет Gzip :-(

0
ответ дан 30 November 2019 в 04:04
поделиться

Я взял ответ Криса Б. и создал полное решение. Вот на случай, если кому-то еще интересно:

import os
import threading
from zipfile import *
import zlib, binascii, struct

class ZipEntryWriter(threading.Thread):
    def __init__(self, zf, zinfo, fileobj):
        self.zf = zf
        self.zinfo = zinfo
        self.fileobj = fileobj

        zinfo.file_size = 0
        zinfo.flag_bits = 0x00
        zinfo.header_offset = zf.fp.tell()

        zf._writecheck(zinfo)
        zf._didModify = True

        zinfo.CRC = 0
        zinfo.compress_size = compress_size = 0
        zf.fp.write(zinfo.FileHeader())

        super(ZipEntryWriter, self).__init__()

    def run(self):
        zinfo = self.zinfo
        zf = self.zf
        file_size = 0
        CRC = 0

        if zinfo.compress_type == ZIP_DEFLATED:
            cmpr = zlib.compressobj(zlib.Z_DEFAULT_COMPRESSION, zlib.DEFLATED, -15)
        else:
            cmpr = None
        while True:
            buf = self.fileobj.read(1024 * 8)
            if not buf:
                self.fileobj.close()
                break

            file_size = file_size + len(buf)
            CRC = binascii.crc32(buf, CRC)
            if cmpr:
                buf = cmpr.compress(buf)
                compress_size = compress_size + len(buf)

            zf.fp.write(buf)

        if cmpr:
            buf = cmpr.flush()
            compress_size = compress_size + len(buf)
            zf.fp.write(buf)
            zinfo.compress_size = compress_size
        else:
            zinfo.compress_size = file_size

        zinfo.CRC = CRC
        zinfo.file_size = file_size

        position = zf.fp.tell()
        zf.fp.seek(zinfo.header_offset + 14, 0)
        zf.fp.write(struct.pack("<lLL", zinfo.CRC, zinfo.compress_size, zinfo.file_size))
        zf.fp.seek(position, 0)
        zf.filelist.append(zinfo)
        zf.NameToInfo[zinfo.filename] = zinfo

class EnhZipFile(ZipFile, object):

    def _current_writer(self):
        return hasattr(self, 'cur_writer') and self.cur_writer or None

    def assert_no_current_writer(self):
        cur_writer = self._current_writer()
        if cur_writer and cur_writer.isAlive():
            raise ValueError('An entry is already started for name: %s' % cur_write.zinfo.filename)

    def write(self, filename, arcname=None, compress_type=None):
        self.assert_no_current_writer()
        super(EnhZipFile, self).write(filename, arcname, compress_type)

    def writestr(self, zinfo_or_arcname, bytes):
        self.assert_no_current_writer()
        super(EnhZipFile, self).writestr(zinfo_or_arcname, bytes)

    def close(self):
        self.finish_entry()
        super(EnhZipFile, self).close()

    def start_entry(self, zipinfo):
        """
        Start writing a new entry with the specified ZipInfo and return a
        file like object. Any data written to the file like object is
        read by a background thread and written directly to the zip file.
        Make sure to close the returned file object, before closing the
        zipfile, or the close() would end up hanging indefinitely.

        Only one entry can be open at any time. If multiple entries need to
        be written, make sure to call finish_entry() before calling any of
        these methods:
        - start_entry
        - write
        - writestr
        It is not necessary to explicitly call finish_entry() before closing
        zipfile.

        Example:
            zf = EnhZipFile('tmp.zip', 'w')
            w = zf.start_entry(ZipInfo('t.txt'))
            w.write("some text")
            w.close()
            zf.close()
        """
        self.assert_no_current_writer()
        r, w = os.pipe()
        self.cur_writer = ZipEntryWriter(self, zipinfo, os.fdopen(r, 'r'))
        self.cur_writer.start()
        return os.fdopen(w, 'w')

    def finish_entry(self, timeout=None):
        """
        Ensure that the ZipEntry that is currently being written is finished.
        Joins on any background thread to exit. It is safe to call this method
        multiple times.
        """
        cur_writer = self._current_writer()
        if not cur_writer or not cur_writer.isAlive():
            return
        cur_writer.join(timeout)

if __name__ == "__main__":
    zf = EnhZipFile('c:/tmp/t.zip', 'w')
    import time
    w = zf.start_entry(ZipInfo('t.txt', time.localtime()[:6]))
    w.write("Line1\n")
    w.write("Line2\n")
    w.close()
    zf.finish_entry()
    w = zf.start_entry(ZipInfo('p.txt', time.localtime()[:6]))
    w.write("Some text\n")
    w.close()
    zf.close()
9
ответ дан 30 November 2019 в 04:04
поделиться
Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: