Как я могу найти узкие места производительности в своем приложении Ruby?

Я сам создал примерный фрейм данных, как вы упомянули выше. Вот модифицированный код.

Изменения, которые я сделал:

  • input$geneExp и input$patients уже являются реактивными, поэтому нет необходимости использовать отдельную реактивную функцию.

  • Отфильтрованные кадры данных для построения графиков используют те же

  • Кроме того, в selectInput установлено значение по умолчанию selected, чтобы избежать начального сообщение об ошибке, когда ничего не выбрано

library(shiny)
library(shinythemes)
library(lattice)

anno_genExp_off <- data.frame(`99901` = c(4.3,6.5,6.6),
                              `99902` = c(5.3,7.5,8.6),
                              `99903` = c(6.3,8.5,9.6),
                              row.names = c("SKI","VWA1","TTLL10"))


anno <- as.matrix(anno_genExp_off)

#Define UI
ui <- fluidPage(
  sidebarPanel(
    titlePanel(title = "Gen3 Gene Expression Data"),
    selectInput(inputId = "patients", 
                label = strong("Please choose patient/s to examine"),
                choices = colnames(anno_genExp_off), 
                selected = colnames(anno_genExp_off)[1],
                multiple = TRUE),
    selectInput(inputId = "geneExp",
                label = "Please select gene expressions/s to examine",
                choices = rownames(anno_genExp_off), 
                selected = rownames(anno_genExp_off)[1],
                multiple = TRUE)),
  mainPanel(plotOutput("testPlot"))  
)

server <- function(input, output) {
  #pdata <- reactive(input$patients)
  #gdata <-reactive(input$geneExp)


  output$testPlot <- renderPlot ({
    levelplot(x = as.matrix(anno_genExp_off[which(rownames(anno_genExp_off) %in% input$geneExp) ,input$patients]), 
              col.regions=colorRampPalette(c("red","green","blue")))
  })
}

shiny::shinyApp(ui,server)


enter image description here

5
задан Andrew Grimm 19 May 2011 в 23:32
поделиться

5 ответов

Ну, существуют определенные известные методы как конкатенация строк, путь медленнее, чем "# {значение}", но для обнаружения, где Вы пишете сценарий, использует большую часть времени или больше времени, чем необходимый, необходимо сделать профилирование. Существует рубиновый драгоценный камень, названный рубиновым профессором. Профилировщик может принести к Вашему уведомлению даже те проблемы производительности, которые могут редко происходить. Я использовал его много и нахожу его очень полезным. Вот некоторая информация об этом непосредственно от ее официального сайта

рубиновый профессор является быстрым профилировщиком кода для Ruby. Его функции включают:

Скорость - это - расширение C и поэтому много раз быстрее, чем типичный профилировщик Ruby.

Режимы - Ruby профессор может измерить много различных параметров, включая времена вызова, использование памяти и возразить выделениям.

Отчеты - могут генерировать текст и перекрестно сослались на отчеты HTML

Плоские Профили - подобный отчетам сгенерированы типичным профилировщиком Ruby

Профили графика - подобный GProf, они показывают, сколько времени метод работает, какие методы называют его и какие методы он называет.

Назовите древовидные профили - выходные результаты в calltree формате подходящий для KCacheGrind профильный инструмент.

Потоки - поддержки, представляющие несколько потоков одновременно

Рекурсивные вызовы - поддержки, представляющие рекурсивные вызовы метода

10
ответ дан 18 December 2019 в 09:54
поделиться

Можно проверить производительность отдельных разделов кода со стандартным модулем Сравнительного теста.

Вы могли также протестировать свой код различных реализаций Ruby (например, 1.9, Rubinius) и видеть, ускоряет ли это вещи.

Конечно, если Ваши проблемы являются алгоритмическими по своей природе затем нет слишком большого количества точки в волнении по поводу вещей как скорости конкатенации строк...

3
ответ дан 18 December 2019 в 09:54
поделиться
3
ответ дан 18 December 2019 в 09:54
поделиться

Существует также ряд dTrace инструменты для Ruby, который можно использовать в dTraceToolkit

0
ответ дан 18 December 2019 в 09:54
поделиться

Помимо того, что записано выше, я также рекомендую наблюдать Масштабирующийся скринкаст Ruby. Это имеет некоторый интересный tips&tricks о том, как написать более быстрый код Ruby.

1
ответ дан 18 December 2019 в 09:54
поделиться
Другие вопросы по тегам:

Похожие вопросы: