Как я пишу сценарий изменения пароля для входа в систему SQL-сервера?

Попробуйте:

# ... 
def launchHud(self):
    window_handle = user32.FindWindowW(0,WINDOW_NAME)
    if window_handle != 0 :
        self.hud = Hud(window_handle)

        self.hud.setWindowFlags(self.windowFlags()     |     # <---
                                Qt.FramelessWindowHint |     # <---
                                Qt.WindowStaysOnTopHint)     # <---
        self.hud.show()                                      # <--- !!!
# ...