Вы можете использовать list comprehension
>>> data = [[1,2,3,4],[5,6,7,8]]
>>> [ d[0] for d in data]
[1, 5]
>>>
Проблема в вашем коде, datapoints_per_controller [z] [z], для выбора 1-го элемента вы должны использовать [0]. Однако вы использовали [z], и он выбрасывает индекс за пределы диапазона.
Я не думаю, что это возможно. Директива AuthUserFile
требует, чтобы путь к файлу был либо абсолютным (от корня файловой системы), либо относительным от корня сервера .