Это может быть немного устаревшим и, возможно, даже немного предвзятым, но это из Оракула. Вы можете перейти к разделу для сравнения Glass Fish с Tom Cat
http://java.sun.com/developer/technicalArticles/glassfish/GFandMySQL_Part1.html
Вы застряли при выполнении ALTER TABLE. Наилучший способ эффективно справиться с этим - использовать установку MASTER-MASTER.
Вы можете сначала изменить MASTER1 и просто использовать MASTER2 в производстве. Затем вы переключаетесь и делаете прямо противоположное.
Не делайте этого в активной системе. Для активной системы сделайте это, пока вы останавливаете систему для регулярного обслуживания.