Как я вставляю строку в определенной строке в нескольких файлах на Unix?

это AWK , а не sed ,

for i in $(<list_of_files)
do
     awk '{if (FNR!=2) print $0; 
           else { print "new line"; print $0}}' $i > ${i}.tmp;
     mv ${i}.tmp $i;
done

perl -pi -we'print "extra line\n" if $. == 3; close ARGV if eof' files

закрытие (ARGV) необходимо для перезапуска счетчика линии $. в начале каждого файла; по умолчанию он считает строки в файлах.

ls | xargs --replace=foo perl -i -ne 'print; print "second line text\n" unless $x++;' foo