Datagrid Инструментария WPF - как Вы выключаете выбор?

Первый щелчок переводит ячейку в режим редактирования, а второй щелчок позволяет изменить флажок. Вы можете изменить это поведение, используя DataGridTemplateColumn вместо DataGridCheckBoxColumn. Замените свой DataGridCheckBoxColumn следующим:

<my:DataGridTemplateColumn MinWidth="50" Width="Auto" Header="Include" SortMemberPath="Include">
   <my:DataGridTemplateColumn.CellTemplate>
      <DataTemplate>
         <CheckBox Style="{StaticResource DataGridCheckBoxStyle}" IsChecked="{Binding Path=Include}" />
      </DataTemplate>
   </my:DataGridTemplateColumn.CellTemplate>
</my:DataGridTemplateColumn>

DataGridCheckBoxStyle просто делает CheckBox немного лучше в DataGrid:

<Style x:Key="DataGridCheckBoxStyle" TargetType="CheckBox" BasedOn="{StaticResource {x:Type CheckBox}}">
   <Setter Property="VerticalAlignment" Value="Center" />
   <Setter Property="Margin" Value="8,0,3,0" />
</Style>