как знать, была ли последняя операция вставкой или обновлением, когда использование вставляет на дублирующемся обновлении в mysql и php?

Можно сказать Eclipse игнорировать эти serialVersionUID предупреждения:

Окно> Предпочтения> Java> Компилятор> Ошибки / Предупреждения> Потенциальные Проблемы программирования

В случае, если Вы не знали, существует много других предупреждений, которые можно включить в этом разделе (или даже иметь, некоторые сообщили как ошибки), многие очень полезны:

• Потенциальные Проблемы программирования: Возможное случайное булево присвоение
• Потенциальные Проблемы программирования: Доступ к нулевому указателю
• Ненужный код: Локальная переменная никогда не читается
• Ненужный код: Избыточная пустая проверка
• Ненужный код: Ненужный бросок или 'instanceof'

и многое другое.