Почему делает C++ ofstream запись (), метод изменяет мои необработанные данные?

Поскольку вы не открываете файл в двоичном режиме, по умолчанию он настроен на форматированный вывод. При форматированном выводе ваша реализация выполняет преобразование символов конца строки, как вы описали.

Вы должны установить режим файла на двоичный , когда вы открываете it:

std::ofstream file;
file.open("filename.jpg", std::ios_base::out | std::ios_base::binary);

Таким образом, поток не пытается подстроить символы новой строки под ваш собственный текст формат.

Попробуйте открыть входящий поток как двоичный. Что-то вроде этого должно работать:

ofstream ofs;
ofs.open(filename, ios::out | ios::binary);
ofs.write(buffer, bufferLen);
ofs.close();