При вызове библиотеки изнутри помощники функционируют в Codeigniter

// ------------------------------------------------------------------------
/**
 * URL String
 *
 * Returns the URI segments.
 *
 * @access  public
 * @return  string
 */
if ( ! function_exists('uri_string'))
{
    function uri_string()
    {
        $CI =& get_instance();
        return $CI->uri->uri_string();
    }
}

Yes, of course.

I disagree with jimyi's answer. CI's own url helper loads the URI class.