Быстрый Google поднимает этот сообщение в блоге (отправленный после того, как Вы задали свой вопрос), который должен, по крайней мере, позволить Вам видеть любые ошибки JavaScript через Мост Отладки Android с помощью команды:
adb logcat WebCore:V *:S
Не совсем то же как полная консоль отладки все же.
Ответ Майкла хорош, но другой вариант - просто exclude:
foo/bar/**
, а затем вручную добавьте файлы .jar. Вы всегда можете добавить файлы, которые исключены правилом игнорирования, которое отменяет игнорирование. Вам просто нужно не забыть добавить любые банки, которые вы создадите в будущем.