Почему бы не добавить переменную для идентификатора элемента и сделать его допускающей повторное использование функцией?
function SelectElement(selectElementId, valueToSelect)
{
var element = document.getElementById(selectElementId);
element.value = valueToSelect;
}
Просто используйте counter:
var section = 1;
$(function() {
$("a.menuitem").click(function() {
...
$("<div></div>").attr("id", "section" + section++).appendTo("#content_pane");
...
return false;
});
});
Также я бы предложил создать элемент, как описано выше.
Вам не нужно этого делать. Если вы можете сохранить идентификатор в переменной, вы можете сохранить и сам элемент (ну, ссылку на элемент) также в переменной.