Что лучший способ состоит в том, чтобы получить stacktrace при использовании многопроцессорной обработки?

Похоже, вам следует избегать создания исключения из вашей основной функции. Вместо этого вы можете поймать его, обработать как значение, возвращаемое основной программе, а затем поднять его там. Повторное генерирование исключений в Python содержит более подробную информацию.