Что управляет языками, показанными, как поддерживается на странице iTunes приложения для iPhone (в правой стороне, ниже "Описания", под "Языками")? Из Руководства разработчика Подключения iTunes кажется, что это не что-то, что Вы выбираете во время представления. Я предполагаю, что это - что-то в пакете.
Вам не нужно ничего указывать в iTunes Connect. Кажется, они сканируют содержимое пакета и просматривают подкаталоги локализации: в моем приложении есть en.lproj, nl.lproj и de.lproj, а iTunes перечисляет "английский, голландский и немецкий" как поддерживаемые языки.