Как я могу считать параметры командной строки из сценария R?

Question

Как я могу считать параметры командной строки из сценария R?

У меня есть сценарий R, для которого я хотел бы иметь возможность предоставить несколько параметров командной строки (а не hardcode значения параметров в самом коде). Сценарий работает на Windows.

Я не могу найти информацию о том, как считать параметры, предоставленные на командной строке в мой сценарий R. Я был бы удивлен, не может ли это быть сделано, поэтому возможно, я просто не использую лучшие ключевые слова в своем поиске Google...

Какие-либо указатели или рекомендации?

275

command-line r parameters

задан monch1962 27 January 2010 в 13:40

4 ответа

Вам нужно Littler (произносится «маленький R»)

Дирк будет за более чем 15 минут, чтобы разработать;)

10

ответ дан 23 November 2019 в 02:11

Добавьте это в верхнюю часть вашего сценария:

args<-commandArgs(TRUE)

Затем вы можете ссылаться на аргументы, переданные как args [1] , args [2] и т. Д.

Затем запустите

Rscript myscript.R arg1 arg2 arg3

, если ваши args представляют собой строки с пробелами в них, приложитесь в двойные кавычки.

91

ответ дан 23 November 2019 в 02:11

Несколько моментов:

Параметры командной строки доступны через commandArgs () , поэтому { {1}} см. справку (commandArgs) для обзора .
Вы можете использовать Rscript.exe на всех платформах, включая Windows. Он будет поддерживать commandArgs () . littler может быть перенесен на Windows, но сейчас живет только на OS X и Linux.
В CRAN есть два дополнительных пакета - getopt и optparse , которые были написаны для синтаксического анализа командной строки.

Редактировать в ноябре 2015 г .: Появились новые альтернативы, и я искренне рекомендую docopt .

124

ответ дан 23 November 2019 в 02:11

Другие вопросы по тегам:

command-line r parameters

Похожие вопросы:

score 205 · Accepted Answer

Ответ Дирка здесь Это все, что вам нужно. Вот минимальный воспроизводимый пример.

Я сделал два файла: EXMPL.BAT и EXMPL.R .

EXMPL.BAT :

 Установите R_Script = «C: \ Program Files \ R-3.0.2 \ bin \ rscript.exe»
 % R_Script% EXMPL.R 2010-01-28 Пример 100> EXMPL.Batch 2> & 1

В качестве альтернативы, используя Rterm.exe :

 Установите r_term = "C: \ Program Files \ R-3.0.2 \ bin \ I386 \ Rterm.exe"
 % R_TRM% --NO RESTORE --NO-SAVE --ARGS 2010-01-28 Пример 100  exmpl.batch 2> & 1

exmpl.r :

 Параметры (echo = true) # Если вы хотите увидеть команды в выходном файле
args <- commandargs (trailingonly = true)
Печать (args)
 # Trailingonly = True означает, что возвращаются только ваши аргументы, проверьте:
 # Печать (commandargs (trailingonly = false))

start_date <- as.date (args [1])
Имя <- args [2]
N <- AS.Integer (args [3])
RM (args)

 # Некоторые вычисления:
X <- RNORM (N)
PNG (вставка (имя ». PNG", SEP = ""))
Участок (start_date + (1л: n), x)
dev.off ()

Сводка (х)

Сохраните оба файла в одном каталоге и запуска EXMPL.BAT . В результате вы получите:

Example.png с некоторым участком
EXMPL.Batch со всем, что было сделано

, вы также можете добавить переменную среды % R_Script% :

"C:\Program Files\R-3.0.2\bin\RScript.exe"

и используйте его в ваших пакетных сценариях как % R_Script% <Аргументы>

Различия между RSCript и RTRM :

RSCript имеет более простые синтаксис
RSPript автоматически выбирает архитектуру на X64 (см. R Установка и администрирование, 2.6 Подготовительные архитектуры для получения подробной информации)
RSCript Опции (echo = true) в файле .r Если вы хотите написать команды в выходной файл