Как сравнить два наборы из 1000 чисел друг против друга?

Я должен проверить примерно 1000 чисел против 1000 других чисел.

Я загрузил оба и сравнил их на стороне сервера: div элементы. Затем сравнил их с помощью JavaScript. Для загрузки страницы по-прежнему требуется 45 секунд (с использованием скрытых элементов div ).

Мне не нужно загружать разные числа.

Есть ли более быстрый алгоритм? Я собираюсь сравнить их на стороне базы данных и просто загрузить номера ошибок, а затем выполнить вызов Ajax для оставшихся номеров, не связанных с ошибками. Но достаточно ли быстрой базы данных MySQL?