Большинство клиентов окон SFTP (как FileZilla), кажется, основано на GUI. Мне нужно что-то, что я могу назвать от пакетных файлов.
pscp и psftp очень легко настраиваются (параметры) и имеют небольшой вес. Открытый исходный код для загрузки.
http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/download.html
Filezilla великолепна и может поддерживать аргументы командной строки .