Запустить скрипт python из R [duplicate]

Если вы хотите прочитать обе строки и ints, решение должно использовать два сканера:

Scanner stringScanner = new Scanner(System.in);
Scanner intScanner = new Scanner(System.in);

intScanner.nextInt();
String s = stringScanner.nextLine(); // unaffected by previous nextInt()
System.out.println(s);

intScanner.close();
stringScanner.close();