Недавно у меня возникла похожая потребность и я обнаружил, что лучшей свободной визуализацией графа была Javascript InfoVis Tooklit. Я не смог найти ничего более легковесного, что бы также отображало разумный подключенный граф. К счастью, есть большое количество примеров/учебников, которые помогут научиться настраивать его для вашего конкретного приложения.
.Посмотрели ли вы API визуализации Google? Это Javascript, и вы можете запустить его в автономном режиме. (плюс у них есть некоторые инструменты на Python/Java для преобразования ваших данных для использования...и т.д.)
.