синтаксическая ошибка рядом с неожиданным токеном `$ 'in \ r' '

Я пытаюсь скомпилировать программное обеспечение для биометрических изображений NIST, и у меня были проблемы весь день. наконец-то исходный код был проверен, и я без проблем установил cygwin (я использовал его раньше), но когда я пошел на компиляцию, я получил эту ошибку:

 $  sh setup.sh  [--without-X11]
 setup.sh: line 94: syntax error near unexpected token `$'in\r''
 'etup.sh: line 94: `    case $1 in

Теперь я уверен, что любой продвинутый программист возглавит в setup.sh и ищите проблемы, но я не особо разбираюсь в кодировке (я компилирую это только потому, что нет предварительно скомпилированных пакетов), поэтому я не знаю, что делать. Я не установите любые библиотеки с помощью cygwin, я просто оставил все по умолчанию. Я пытаюсь следовать руководству NBIS, но я не очень хорошо его понимаю, и поэтому я плохо борюсь. Может, взглянув на это, вы можете кое-что заметить Я пропустил: http://www.nist.gov/customcf/get_pdf.cfm?pub_id=51097